Для повышения скилов — меняйте все на root, можете рядом поднять такой же образ дистрибутива — и вперед сравнивать владельцев.
root профиксит ssh как минимум. Все остальные сервисы, должны иметь своих юзеров.
Ну а проще всего, бэкап и реформат.
Настроить sendmail, чтобы все слал через google smtp, или смените хостнейм. (не уверен, что сендмеилу можно указать, чтобы использовать публичный MX для специфического домена)