экспортировать каждую таблицу в отдельный файл, например.
А почему сложно импортировать?
mysqldump bd_name > bd.sql
scp bd.sql newsrv:
ssh newsrv
mysql bd < bd.sql
все, размер значения не имеет. Надо только иметь свободное место, чтобы дамп поместился.