Написала в техподдержку хостинг-провайдера, которые связались с разработчиками CloudLinux (ISP). Выяснилось, что хостер не ограничивает использование процессора, а число "3200%", отображаемое в статистике является ошибкой ПО, которая в новой версии будет исправлена.