Алексей POS_troi, Спасибо, как оказалось проблемы были не только с правами, но и с именами файлов например имя контроллера было указано с маленькой буквы, и так работало в Windows хостинг на Линуксе и вылечилось когда я поправил имя класса контроллера и названия контроллера с маленькой на большую букву.
