...
index index.php index.html index.htm;
location ~ \.php$ {
...
fastcgi_index index.php;
}
Судя по конфигу, не указан index - документ по умолчанию. В случае использования nginx + php-fpm его указывать нужно в 2 местах, как в коде выше.
Кстати, конфиг слишком сложен и ужасен, уверен, что его можно сделать без этой кучи реврайтов, а так же без if констукций. Рекомендую почитать про try_files и поискать готовые конфиги nginx для DLE, уверен, они существуют и в более приятном виде.
