mak_arti

Здесь временная таблица не нужна: все можно сделать одним запросом:

select distinct c.CrossArticleId from Crosses c inner join Crosses f 
on c.ArticleId=f.CrossArticleId where f.ArticleId=1

А чтобы избежать сканирования всей таблицы, создайте (если их ещё нет)индексы по полям Crosses.ArticleId и Crosses.CrossArticleId - например, как в предыдущем ответе написано. И пусть работает и оптимизирует запрос планировщик: он кремниевый, и у него есть статистика по индексам. Если вдруг сомневаетесь в планировщике - посмотрите план выполнения запроса.
Индексы - это ключевой момент: без них серверу придется сканировать всю таблицу.

Запрос можно оптимизировать тремя способами:
1) Использовать индексы по полям ArticleId и CrossArticleId в таблице Crosses;
2) Использовать группировку по полю CrossArticleId во временной таблице @tempFlatCrosses, чтобы избежать дубликатов при соединении с таблицей Crosses;
3) Использовать оператор EXISTS, вместо INNER JOIN, чтобы проверить наличие соответствующих записей в таблице Crosses, без возврата лишних данных.

-- Создаем индексы по полям ArticleId и CrossArticleId в таблице Crosses
CREATE INDEX idx_crosses_articleid ON Crosses (ArticleId);
CREATE INDEX idx_crosses_crossarticleid ON Crosses (CrossArticleId);

-- Достаем все строки, у которых ArticleId = 1 и группируем по CrossArticleId
SELECT ArticleId, CrossArticleId
INTO @tempFlatCrosses
FROM Crosses
WHERE ArticleId = 1
GROUP BY CrossArticleId;

-- Делаем выборку из таблицы Crosses, используя оператор EXISTS
SELECT c.ArticleId
FROM Crosses c
WHERE EXISTS (
  SELECT 1
  FROM @tempFlatCrosses f
  WHERE c.CrossArticleId = f.CrossArticleId
);