Ерлан Ибраев

Считайте и думайте.
Nested Set - быстрое чтение, но долгая вставка
ParentID - быстрая вставка и долгое чтение
Без знания какое дерево у вас будет и какие задачи оно будет решать нельзя сказать однозначно что лучше.

Классика же :-)

SELECT ID, NAME AS VALUE FROM TABLE?!

Смешались в кучу кони, люди...
SQL - это декларативный ЯП, основанный на РМД.
NoSQL - это общее название все что не SQL, но БД.
В каждом случае нужно учить/понимать что-то свое.
Т.е. общего понимания для SQL/NoSQL нет.
Но если понимать РМД и знать SQL, то можно более-менее работать со всеми SQL БД.
С NoSQL - не так. Каждый NoSQL уникален. Соответственно понимать нужно каждый по отдельности

Использую ORM пока хватает возможностей Spring Data Jpa.
Как только перестает хватать, то без ORM.

MySQL - никак
В PostgreSQL, например, через with recurisve

solr, elatsic search :-)