Конфиг с виду правильный, нужно убедится, что он подгрузился, посмотреть access/error логи.
Я обычно немного по-другому делаю симлинки:
ln -s ../sites-available/mysecondwebsite.com mysecondwebsite.com
Очень полезно делать отдельные access.log для каждого виртуального сервера
