Тогда нужно смотреть правильные ли значения попадают в IN( ... ) . Советую просто составить plain запрос и напрямую в базе попробовать его запустить и тогда увидишь результаты запроса сразу, без прослойки php, это вообще хороший тон, если не используешь какой-нибудь билдер/active records/ORM.
