Скажу так. То что вы говорите это просто не возможно, управлять шарами Samba из «Проводника» Windows. Ведь samba это серверная служба Linux и настраивается доступ к шарам только из под Linux. На этапе конфигурирования от винды нужны только доменные службы в итоге в Linux получаем учетки домена и им раздаем права.
Для этих задач подходит любой Linux дистрибутив. По легкости настройки всего этого добра мне больше понравился OpenSUSE (личное мнение) вот тут обсуждение. А по поводу backup есть разные способы и их очень много.