Ежели собираетесь использовать этот диск в системах, которые не понимают NTFS (то есть не с Windows)....
Но только что это за загадочные системы.
По чтению все современные NTFS умеют.
Разве что по записи не все умеют.
Ну или это будет какое то embedded решение, которое умеет только FAT....
Надежность FAT ниже РАДИКАЛЬНО.