latteo

У ioncube есть Online Encoder за 0,5 бакса я файлики до 30КБ скармливал (этого более чем достаточно для проверки лицензии и нескольких критичных для работы всего скрипта объектов)

Вам не надо его разбивать на куски - php.net/manual/ru/function.hash-file.php

Если реализовывать алгоритм самостоятельно, то php очень-очень медленно считает SHA256.

Оптимальнее всего по скорости будет найти системную утилиту, которая может хешировать весь файл и вызывать через exec, system, etc