Как сделать чтобы команда startTime была всегда активна?

Ома Сабыров, "решение в лоб" обрабатывать события load и unload и помещаете имя пользователя в массив не на клиенте, а дальше, используя long polling, получайте этот массив и выводите в бегущую строку .

Как поправить уведомления?

Не позиционируйте абсолютно само уведомление, а позиционируйте какой-то блок(wrapper). А в него уже помещайте уведомления, как простые блоки.

Как сделать чтобы команда startTime была всегда активна?

Ома Сабыров, вы объявляете переменную startTime, в которую помещаете значение текущего времени, как уже было сказано выше переменная не имеет свойства включаться или выключаться, она просто хранит в себе это значение. Таким образом вы в любой момент можете обратиться к этой переменной и использовать то значение, которое сохранено в ней. Например, если после строчки var startTime = (new Date().getTime());
написать console.log(startTime); то в консоль нам выведется значение того момента времени, в который был запущен этот скрипт.
Т.к. вы в своем коде дальше никак не используете эту переменную, поэтому она нигде не отображается.

Почему цель в метрике срабатывает при отправке пустой формы?

RaggaMaffin, на сколько я помню у jQuery validation плагина есть метод submitHandler, который срабатывает при валидной форме. Добавьте в него строку yaCounter53521924.reachGoal ('ask');

Для реальных проектов на React используют CDN или CRA?

moreleaksILoveMS, CDN по факту это аналог npm/yarn install в случае React и React-DOM. Если Вам удобно постоянно прописывать все библиотеки, в том числе и babel, в head, то используйте CDN. CRA же в свою очередь создаст базовую структуру простого приложения, не только скачает библиотеки, но и настроит index.html и index.js как минимум.