Зачем переносить базу на другой диск, если у вас и первым практически никто, кроме мускуля не пользуется (если, конечно, апач не обрабатывает тысячи одновременных запросов)? Нужно повышать производительность дисковой подсистемы, а не менять шило на мыло.
