Скопировать данные во временный каталог на большом разделе, удалить маленький раздел и объединить его с большим. Затем переименовать временный каталог в /home. Нюансы зависят от файловой системы.
Особого смысла выносить домашние каталоги на отдельный раздел нет, особенно, если физически это будет одно и то же устройство.