Константин Самилко

Что конкретно "не так"?
Вам может помочь как strace и запуск процесса с его помощью.
Так и perf top, чтобы посмотреть, на что тратит свое время процесс.
Но, все равно, пока не понятно, что конкретно, вас не устраивает в вашем процессе, чтобы задать вам правильное направление.

Зависит от того, какие данные у вас на рейдах и сервере.
Если это просто файлы, то Конфиги tar+gzip и на другой сервер.
А файлики с рейда по причине тяжести, rsync с ежедневным дотягиванием в какое-то время.
Если у вас БД, то бекапить надо по другому.
Опишите что у вас есть для бекапа (свободное место и т.д.), и какими методами можно пользоваться (нельзя чтобы ушло за пределы компании и т.д.)