Ксения

Пишут на чем угодно. Смотря куда и каким образом внедряться.
сейчас популярны c, c++, .net, js.

Чтобы писать вирус, нужно знать не столько язык, сколько архитектуру и принципы работы операционки и ПО, в которое собираетесь внедряться.

Начальная ступень для все просящих чудо-учебники про все в одном: научиться пользоваться поискам, тысячи уже однотипных вопросов.
Книги и ресурсы по информационной безопасности