kraut

как вариант, в тесте подменять basePath директорию, из которой берутся фикстуры:

public function setUp(){
	$sOldBasePath = $this->getFixtureManager()->basePath;
	$this->getFixtureManager()->basePath = Yii::getPathOfAlias( 'application.tests.fixtures.' . __CLASS__ );
	parent::setUp();
	$this->getFixtureManager()->basePath = $sOldBasePath;
}

ну и соответственно складывать фикстуры для каждого теста в отдельную папку.