knekrasov

Вообще интересная мысль для задачки Just for fun.
Хотя на самом деле не совсем понятно, что в итоге нужно получить: просто отчет о недостающих полях (в предположении о совпадении имен таблиц) или комплексный анализ графов отношений (плюс поиск соответствий между таблицами двух БД).

Вообще говоря, регулярные выражения для таких задач не предназначены. Разбирать контекстно-зависимые выражения бесконтекстной грамматикой — мысль все-таки порочная.
Я бы разбил выражение на лексемы и обработал вручную.