решил вопрос. Может кому пригодится:
<?php
require_once( $_SERVER['DOCUMENT_ROOT'] . '/wp-load.php' );
global $post;
global $wpdb;
?>
<?php $markers = get_posts ('post_type=markers&order=ASC'); ?>
<?php $arr = array(); ?>
<?php if ($markers) :?>
<?php foreach ($markers as $post) : setup_postdata ($post); ?>
<?php
$arr[get_the_ID()]['type'] = 'Feature';
$arr[get_the_ID()]['id'] = '0';
$arr[get_the_ID()]['geometry']['type'] = 'Point';
$arr[get_the_ID()]['geometry']['coordinates'] = array(55.831903, 37.411961);
$arr[get_the_ID()]['properties']['balloonContent'] = 'Содержимое балуна';
$arr[get_the_ID()]['properties']['clusterCaption'] = 'Еще одна метка';
$arr[get_the_ID()]['properties']['hintContent'] = 'Текст подсказки';
?>
<?php endforeach; ?>
<?php endif; ?>
<?php wp_reset_postdata(); ?>
<?php
$array = array(
"type" => "FeatureCollection",
"features" => array_values($arr)
);
?>
<?php echo json_encode($array); ?>
код ни идиален, комментарии и замечания приветствуются)
