Когда вы что-то меняете через свой редактор, то тригерите событие изменения, и понятное дело storm может их обработать и отправить на удалённый сервер.
А как вы представляете себе тригеры событий на изменения файлов на сервере без пересинхронизации?
Я бы порекомендовал вообще сделать полную очистку диска перед уходом с текущего места работы.
Мало ли какие грязные руки и мысли будут у нового владельца компьютера.