Не писать сразу в базу, а создать очередь, в виде промежуточной таблицы или кеша или файла. И вот из нее брать по одной записи и заносить в боевую (например кроном раз в минуту), тогда не будет одновременности.
if (Yii::$app->session->hasFlash('update')) {
echo Growl::widget([
'body' => Yii::$app->session->getFlash('update')
]);
Yii::$app->session->removeFlash('update');
}
'body' => Yii::$app->session->removeFlash('update')