Aleksandr

Искать прогу, которая умеет делать "обратный" инжиниринг БД MySQL... (название к сожалению запамятовал!)
Такая апликуха тебе практически шедевр сделает в виде картинки :)
Копать в сторону - dit.isuct.ru/Publish_RUP/core.base_rup/guidances/t...
(MySQL увы не упоминается)

"Господа - вы звери, господа!" (с) "Жестокий романс"
Лить куда-то в realtime бекап с сервера БД на другой хост - это извращение высочайшего уровня! (...и балансирует на грани нищебродства)
Либо уж если так делаете - нужно будет добавлять проверку на то, что бекап валидный (типо пробовать после создания развернуть из бекапа базу...)
Простой пример: в момент создания бекапа кратковременно пропадает сетевой коннект (а возможно и многократно... величина исчезновения связи между хостами - от нескольких миллисекунд до 1-3 секунд...). Есть вероятность, что программа бекапирования не успеет "среагировать" на такие коллизии и по завершению процесса выдаст что бекап успешно создан! Хотя такую бекап-копию - сразу на помойку...
Ибо уже кровью не одного поколения админов выписан разумный алгоритм: создаётся "локальная" бекап-копия и потом выливается уже на необходимый хост... При нынешних ценах на SATA-винты (десяток на ведро!) - разумнее купить и поставить самый дешёвый SATA-винт, чем заниматься извращениями, ИМХО...

Судя по всему, какая-то транзакция завершилась некорректно... самое быстрое решение проблемы - восстановить БД из бекапа (если он конечно есть)! Кроме того в самом логе указано - выключить логирование, и затем повторно включить его...
Учитывая что это VPS-хостинг - думаю, ситуацию поможет разрешить хостер! Т.к. налицо есть подвисший процесс/демон MySQL (невозможно достучаться до сокета MySQL)
Одним из вариантов проверить: отдетачить сбойную базу и подсунуть заведомо исправную или создать "пустышку"...