Файл, увы, в таком виде не парсится логическим образом, поэтому на разумные обьекты его не разбить.
Можешь просто по строкам загружать, через with open readline, добавляя id'шники.
Как работать с PyMongo можно почитать в документации:
https://pymongo.readthedocs.io/en/stable/ 
