Для тех, кто столкнулся с подобной проблемой.
Чтобы добавить свободное место к разделу /home, запускаем ОС с live-usb/live-cd, далее заходим в Gparted и нажимаем расширить раздел /home, там перетягиваем ползунок расширяя раздел. Оказывается все просто;)