karazyabko

В первую очередь почитай про принципы работы REST (ну или Soap, смотря что использовать будешь). Ну и опытом хабратоварищей можно воспользоваться:
Раз
Два

— NetBeans — php, js
— Navicat Lite — MySql
— muCommander — ftp, sftp