Какие манипуляции конкретно Вы хотите проводить? Объять все процессы в клетке думаю Вам не удастся. Нужно останавливаться на определённом уровне абстракции.
Вот например по развитию из одноклеточного в многоклеточный:
www.evolbiol.ru/doklad_seminar_20.htm 
