Собирал сервера 1U неоднократно. Уже сразу вижу грабли, на которые вы идете прямым ходом. Обе материнки ваши не подойдут для серверного решения. Дело в том, что вентиляторы в корпусах 1U дуют вдоль платы с "лица" корпуса к "попе". А планки памяти у вас стоят поперек потока. Ну, и исходя из всей совокупности написанного, я понимаю, что вам нужен толковый инженер, например такой как я. Поэтому моя рекомендация - связаться со мной в почту (в профиле есть), и мы все обсудим.