juneuniversum

$query = '
   SELECT
       code
   FROM
        table
   WHERE
        id = ?';

использует второй вариант и начинайте с новой строки (Будет почти тоже самое что и 1-ый вариант).

+ используйте одинарные кавычки
+ используйте плейсхолдеры

Я не PHPист, но первый вариант выглядит убого. По крайней мере с подсветкой хабра. Да и приклеенный запрос к стенке, тогда как всё остальное сделано с отступами, выглядит не логично.

Это очень коряво. одно название класса «D» уже достаточно, чтобы понять, что код будет хреновым.
Это не ООП код, не обманывайте себя, классы Вам не нужны здесь. Если Вы любите статические методы — пишите функции, т.к. статические методы это процедурное программирование.

Искали ли Вы существующие готовые решения? Вот это, например: symfony.com/doc/current/components/routing.html

Тратьте больше времени на чтение книг, меньше на изобретение того, что уже сотни раз изобретено.