А зачем здесь подзапрос, если таблица одна и та же?

SELECT DISTINCT
    email,
    phone
  FROM 
    table

Но если это временная таблица - то можно просто напросто сделать выборку с подзапросом как-то так:

SELECT * FROM table1 t1, (
SELECT DISTINCT
    email,
    phone
  FROM 
    table) AS t2
WHERE t1.email = t2.email AND t1.phone = t2.phone

Используйте GROUP BY + GROUP_CONCAT
Либо сделайте пост-обработку результатов SQL запроса, сгруппировав данные по ID пользователя

SELECT GROUP_CONCAT(post_comment.comment_content SEPARATOR ' ') FROM users GROUP BY users.user_id;

Несколько возможных вариантов:
1) Подобный вопрос. Используйте group by post_id + group_concat для tag.name
2) JSON_ARRAYAGG(col_or_expr). Т.е. формировать сразу JSON массив

Воздушное судно
- id судна (pk, a_i)
- бортовой номер (unique)
- количество мест
- тип судна (id из следующей таблицы)

Типы воздушных суден
- id типа
- название (самолет, вертолет, да что угодно)

Рейс
- id рейса (pk, a_i)
- название рейса
- дата рейса
- количество свободных мест (опционально)
- количество занятых мест (опционально)

Связующая таблица самолет-рейс
- id самолета (id, 1-я таблица)
- id рейса (id, 2-я таблица)

Пассажиры
- id пассажира (pk, a_i)
- фамилия
- имя

Регистрация на рейс
- id рейса
- id пассажира
- дата регистрации

Занятые места
- id рейса
- id пассажира
- номер места из таблицы ниже

Места в воздушном судне
- id места
- id судна
- номер места

Я бы такую структуру сделал.
Количества мест - опциональны, их можно рассчитывать по таблице с регистрацией на рейс.

Исходя из двух таблиц - данную задачу решить сложно: т.к. это получается ни разу не система для управления аэропортом + в таблице с рейсами - будет постоянное дублирование данных в том случае, если их не выносить в отдельную сущность.