ЕМНИП, надо в меню КУРСА сделать его бэкап, файл бэкапа - это и есть курс, который можно развернуть в другом moodle. Только были проблемы с форматом бэкапа версий moodle до 1.9 включительно (zip-файл) и более поздними (mbz-файл).
А, вообще, легче посмотреть здесь -
https://docs.moodle.org/32/en/Course_backup#Backin... и
https://docs.moodle.org/32/en/Course_restore 