Рекомендую Adobe Acrobat Pro. Ввод данных в форму и подсчёт это легко делается прям внутри pdf. Вот насчёт вывода не знаю, у меня нет особо опыта работы с ней, может ли она читать тут же введённые данные. Погуглите в общем. Все данные сохраняются и экспортируются таблицами или просто xml-ками. А главное чертовски кроссплатформенно.
