1. Скорее всего загрузчик никуда не делся. Попробуйте перезагрузиться в безопасном режиме (зажмите shift при клике на "restart") и поискать его.
2. С помощью
bcdedit попробуйте сделать основным загрузчиком grub. Примерно так:
bcdedit /set {bootmgr} path \EFI\linuxmint\grubx64.efi