Alex

var usersWithLikes = {};

thumbsUp_data.forEach(function(data) {
    data.users.forEach(function(value) {
        // Если переменная пуста, положим туда 0
        usersWithLikes[value.id] = usersWithLikes[value.id] || 0;
        
        // Прибавим лайк
        usersWithLikes[value.id] += value.like;
    });
});

// На выходе получился хеш. Если надо именно массив, можно сделать так:
usersWithLikes = Array.prototype.slice.call(usersWithLikes, 0);