Никак.
Есть публичные геобазы, есть whois. Они безбожно врут обычно.
Провайдер получает адреса "прописывая" их в Москву (по адресу юр. лица). Дальше никто не запрещает ему использовать эти адреса во Владивостоке.
Более того, трафик для этого адреса действительно может приниматься провайдером на бордере в Москве, а дальше по своим собственным каналам гнаться в Сибирь.
Так что ответ вкратце:
1) потрейсить адрес, возможно там будут намеки (ну там название роутера вида hq-bb-be10.msk.corbina.net в последнем хопе или удастся по другим косвенным признакам определить местоположение последнего хопа).
2) узнать провайдера
3) спросить у провайдера (если вы полиция).
Если не полиция/нет знакомых - то, в общем-то, никак. Только полагаться на врущую публичную геобазу.