Нам не нравится как взаимодействуют фронтенд и бэкэнд сейчас (фронт и бэк в разных репозиториях и мы хотим чтобы все было в одном месте.
Подключите репозиторий с вёрсткой подмодулем к основному репозиторию, а на сервере проставьте симлинки на файлы css и js.
https://git-scm.com/book/ru/v2/%D0%98%D0%BD%D1%81%...
