Андрей Инишев

Есть еще chmod. Если веб-сервер запущен от имени другого юзера, то у него должны быть права как минимум на чтение. Попробуйте chmod 755 <файло или директория>. Есть опция -R для рекурсивного задания прав. https://ru.wikipedia.org/wiki/Chmod

Догадываюсь, что в Вашем случае больше подходит supervisor + очередь задач вроде gearman или php-resque + отправка задач на обработку с помощью крона.