Можно использовать ionCube, Zend для более сильной защиты. Обфускация может защитить ваш скрипт от обычных пользователей. Эти способы могут потянуть время. За это время необходимо дорабатывать свой продукт и как можно чаще выпускать обновления. Если обновления будут выходить часто, то пока покупатели взломают скрипт, он уже будет неактуален, так как выйдет новая версия.
