Каждый хранит у себя на рабочей машине исходники сайта и, как тому способствует философия гита, свой локальный репозиторий. Каждый делает свои задачи в своих ветках, регулярно синхронизируясь с master веткой, в которой лежит стабильный билд. Каждый пушит свои ветки на удаленный репозиторий, открывает мерж реквесты, администратор репозитория после придуманной вами последовательности действий принимает их, сливая в мастер. На любые конфликты при слиянии веток гит будет указывать, требуя сказать, как это дело смержить, что-то перезатереть можно только руками - и будет видно, чьими.
Это всяко будет безопаснее в плане перезатирания, чем работа хором над одной копией исходников, лежащей в одном месте.