если я правильно понял то вам нужно создать 4 репозитория. в первом будет ваше ядро. а в 3-х других собственно проекты для "разных заказчиков". и вот в эти 3 первый репозиторий будет подключаться через git submodule https://git-scm.com/book/ru/v1/%D0%98%D0%BD%D1%81%...
