igrishaev

Проверьте пути питона, нет ли там кириллицы:

python manage.py shell
>>> import sys
>>> print sys.path

У нас в конторе Джанго с Мускулем крутится на Винде, полет нормальный.
Ошибка в этом операторе:
>>> import MySQLdb as Database
Откройте интерактивный Питон и выполните этот код.
Вопрос — у вас классический Питон или ActivePython? Последний хранит пакеты по умолчанию не в site-packages, а где-то в жопе Винды, при запуске Джанги через Апач/IIS этот путь может не подхватиться.

Правильно, что выбрали wsgi. Если выбирать между fcgi и wsgi, то со вторым намного проще.