Vladimir Zhurkin

Попробуйте задать путь полностью.

"C:\Program Files (x86)\Python\python.exe" "C:\Program Files (x86)\Python\Scripts\pyinstaller-script.py" script_to_compile.py

Один из вариантов , посмотреть что за установщик используется и если есть тихий режим использовать его.
Второй вариант использовать https://www.autoitscript.com/site/autoit/ , вплоть до нажатие кнопок итд.

Вообще на примере книги Лутц www.books.ru/books/izuchaem-python-4-e-izdanie-816...
Там сказано как читать эту книгу и в конце даетя контрольный список вопросов, если вы не смогли ответить - значит надо еще раз перечитать или читать более медленно и внимательно с первого раза.
Потом не зацикливайтесь, это книга. Читайте дальше. Когда прочтете всю книгу, отложите и читайте ее еще раз.
Потом можно опять отложить и опять читать. Вы же не к экзамену готовитесь, да и зубрить что-бы стать очередным индусом программистом - это явно не очень хороший путь.

>И работатет в фоновом режиме без терминала и прочего. Тоесть только показивет собщение ?
Извените, а куда он будет вам показывать сообщение ? Только если в лог писать.
Или вы в X выводите инфомацию ?

В любом случаи вот вам как писать демонов
stackoverflow.com/questions/473620/how-do-you-crea...
habrahabr.ru/post/176067

Для запуска при старте системы надо написать скрипт для старта вашей программы. В теории можно и на bash забацать демона. Если вам интересен этот вариант, я дам пример скрипта.