i_samartsev

Ожидается, что структура локальной папки следующая

├── Module
│   ├── __init__.py
│   └── submodule.py
└── script.py

2 способа на выбор
В начале скрипта еще и добавить
import Module.submodule

или
в Module/__init__.py прописать:
from . import submodule

Для классов:
type.__setattr__(MyClass, 'number', 5)
MyClass.__dict__['number']