Решили проблему?
У меня тоже самое :((( Причём если включить SOAP, то на него всё приходит как надо. Пока вижу выход в выставлении счетов по REST, а приёме по SOAP.
Зачем изобретать велосипед? Поставьте любой маленький web-сервер, который и будет принимать соединения клиентов по протоколу HTTP, передавать файлы и параметры php скрипту.
Клиент можно написать на Си с библиотекой curl и не нужно ломать голову с передачей файлов. Всё будет работать прозрачно по протоколу HTTP. Для винды скомпилировать через cygwin.
psrafo, не тупи. sqlite это не какая-то программа отдельная, это тупо обычный файл со своей структурой (как XLS у Экселя, если не понятно). Из php с этим файлом можно работать через расширение PHP. Расширение должно быть подключено к PHP хостером.