Кажется, мне удалось понять в чем. Раньше вызов VK.Auth.login(function(){}) подразумевал, что ты просишь добавить приложение к себе, и по-умолчанию так-же добавлялось правило «Разрешить приложению присылать Вам уведомления». Теперь, судя по всему, умолчание сняли, и нужно явно указывать хоть один пермишн. Т.е. эквивалент старого вызова теперь — VK.Auth.login(function(){}, 1).
