Как получить stdout в реальном времени, а не по окончании обработки команды (python3 pyqt/pyside subprocess)?

for line in p.stdout: выполняется в основном потоке? В таком случае возможно заблокирован main loop и окно не перерисовывается.

https://github.com/hlamer/enki/blob/master/enki/li... - Popen, который не блокируется на чтении. Читайте коментарии, осмысливайте захардкоженные константы.