Грузишься с установочной флешки в режим Try system, т.е. не в установщик, а в систему.
Запускаешь Терминал (Ctrl+Alt+T)
В терминале:
sudo fdisk -l
и на Enter, чтобы узнать имя корневого раздела, на который установлена система (может быть и sdaX, и sdbX, и sdcX, и sddX и т.д...)
Далее пишешь:
sudo fsck -f /dev/sdXX
и на Enter.
Ждёшь результата проверки и исправления ошибок, а может и фиксации битых кластеров.
Если спросит, сделать то-то, то-то, Y и на Enter.
По завершении перезагруз в систему.
Войдёшь в систему, сразу делай что-то, чтобы забэкапить данные, ибо скоро диску кердык будет вообще...