gromsterus

Если правильно понял вопрос

tree_ids_subquery = Genre.objects \
    .filter(product__name=u'Product',
            product__vendor__name=u'Vendor') \
    .values_list('tree_id', flat=True) \
    .distinct()

genres = Genre.objects.filter(tree_id__in=tree_ids_subquery)

Можно добавить индексы по полям "name" и добавить в Genre (будет строить ветки, сортируя по полю 'name')

class MPTTMeta:
    order_insertion_by = ['name']