Георгий Могелашвили

если я правильно понял вопрос, то можно это сделать через фабрику контроллеров

Global.asax.cs:

protected void Application_Start()
{
    // ...

    ControllerBuilder.Current.SetControllerFactory(new NinjectControllerFactory());
}

NinjectControllerFactory.cs:

public class NinjectControllerFactory : DefaultControllerFactory
    {
        private IKernel _ninjectKernel;

        public NinjectControllerFactory()
        {
            _ninjectKernel = new StandardKernel();
            AddBindings();
        }

        protected override IController GetControllerInstance(System.Web.Routing.RequestContext requestContext, Type controllerType)
        {
            return controllerType == null
                       ? null
                       : (IController)_ninjectKernel.Get(controllerType);
        }

        private void AddBindings()
        {
            _ninjectKernel.Bind<ISomeInterface>().To<SomeClass>();            
        }
    }

Controller:

public class MyController : Controller
{
        public MyController(ISomeInterface inter)
        {
            _inter = inter;
        }
        
        // ...
}

Пример взят из книжки Pro ASP NET MVC 3 Framework авторства Adam Freeman и Steven Sanderson