Ответ прост, в micrometer нет метрики за минуту, так как это НЕ задача метрики. Это делается уже в агрегаторе. В моем случае это Prometheus и его range(...)[5s], а в метрике используется counter - монотонно возрастающая последовательность, на основе которой можно уже на стороне Grafana вычислить дельту за любой период. То, что приложение может перезапускаться, не играет роли, так как в Grafana исчезнет одино приложение и появится другое, а итог будет считаться как сумма по всем приложениям за указанный интервал времени.